在凈化工程中，潔凈車間內的專業儀器檢測，起著決定性的作用，前期的廠房搭建是一部分，車間內的潔凈等級設計又是另一部分不可缺少的部分。說到專業儀器檢測的工作原理一、潔凈車間空氣凈化系統的工作原理是氣相吸附中常使用顆粒活性炭，通常是讓氣流通過活性炭層進行吸附。二、化工廠、皮革廠、造漆廠以及使用各種有機溶劑的工程排出的氣體中，含有各種有機溶劑、無機及有機硫化物、烴類、氯氣、油、汞及其他對環境有害的成分，可以用活性炭進行吸附以后再排放。

醫藥潔凈廠房是保證醫藥產品生產質量，防止生產環境對產品的污染，生產區域需要滿足規定的環境參數。按用途主要分為以下幾種：原料藥車間、無菌藥品車間、生物制品車間、血液制品車間、中藥制劑車間等。專業儀器檢測項目：空氣潔凈度等級、懸浮粒子數、沉降菌、浮游菌、溫度、相對濕度、靜壓差、照度、照度均勻度、噪聲、換氣次數、氣流流型、風速、自凈時間、送風量、新風量。專業儀器檢測依據：GB 50457-2008《醫藥工業潔凈廠房設計規范》GB/T 16292-2010《醫藥工業潔凈室（區）懸浮粒子的測試方法》

專業儀器檢測服務范圍：醫院手術室及潔凈用房、醫藥工業潔凈廠房、食品企業潔凈車間、生物類企業潔凈室、化妝品企業潔凈室、電子工業潔凈廠房等。專業儀器檢測項目：懸浮粒子、浮游菌、沉降菌、溫度、相對濕度、風速、截面風速不均勻度、風量、換氣次數、壓差、照度、噪聲、工作臺與工人手表面細菌總數、紫外線輻射強度、空氣中細菌菌落總數、空氣過濾器現場掃描檢漏、微振、靜電、氣流方向與顯形、自凈時間等。

專業儀器檢測指公共場所的發證監測、復證監測和經常性衛生監測。發證監測和復證監測是指對公共場所經營單位的衛生狀況進行監測，評價其衛生狀況，確定是否發放衛生許可證。經常性衛生監測是指公共場所經營單位在取得為生許可證之日起，至下次復核為生許可證之間的一段時間內所進行的衛生監測，監測衛生狀況達標情況，促使衛生狀況鞏固提高。專業儀器檢測指標有CO、CO2、氨、甲醛、照度、新風量、噪聲、溫度、濕度、風速、臭氧、細菌總數、大腸菌群、可吸入顆粒物、總揮發性有機物（TVOC）等。